BMW F800 GT приводится в движение двухцилиндровым рядным двигателем с водяным охлаждением объёмом 798 кубических сантиметров. Мотор с электронным впрыском топлива развивает 90 лошадиных сил мощности (66 кВт) при 8000 оборотах в минуту.